蛋黃卵磷脂于大豆卵磷脂的來源和生產工藝都有所不同，蛋黃磷脂來源是禽類卵黃，大豆磷脂的來源是大豆油。來源的不同造成了生產工藝的不同。

 蛋黃磷脂的提取方法是有機溶劑提純法和超臨界CO2萃取法。單純的有機溶劑萃取工藝生產出的產品純度比較低，膽固醇含量較高，產品中會殘留有害的有機溶劑，并且工藝比較復雜。而超臨界CO2萃取作為一種新型的分離技術，具有工藝簡單、環(huán)保、高效低耗能、無溶劑殘留、選擇性高等優(yōu)點，生產出的卵磷脂質量高，是制取高純度蛋黃卵磷脂的先進工藝。

 大豆磷脂的生產工藝相對比較簡單。大多食用、藥用卵磷脂的生產原料都是大豆。在精煉過的大豆油中加水，分離水合物再蒸干就可以得到毛磷脂。然后經過減壓濃縮得到濃縮磷脂，將大豆?jié)饪s磷脂進行脫脂，分離，脫溶，干燥制得去油磷脂，去油磷脂具有較好的親水性功能，能夠解決在食品應用上的許多問題。然后把去油磷脂進一步精制純化得到PC含量較高的卵磷脂，可適用于制藥等方面。由于來源廣泛，生產工藝簡單，且價格低廉，因此目前使用的商品卵磷脂一般是大豆磷脂。

 大豆卵磷脂與蛋黃卵磷脂的組成有所不同，兩者所含磷脂組分上有一定的差異。和大豆磷脂相比，蛋黃磷脂PC含量較高，基本上不含磷脂酰肌醇和脂肪酸。

 大豆卵磷脂與蛋黃卵磷脂性質的有所不同，蛋黃卵磷脂PC含量較高，但是必需脂肪酸卻比較低。PC是神經遞質乙酰膽堿的重要來源，蛋黃卵磷脂能防治老年性癡呆；而必需脂肪酸為人體的新陳代謝所必需，所以大豆卵磷脂的生理活性比較廣。同時，蛋黃卵磷脂的來源是動物的胚胎蛋黃，更有利于人體的吸收。

 蛋黃卵磷脂含有一定量的花生四烯酸，能夠提供動物所需?；ㄉ南┧釋儆谙盗斜匦柚舅?，和維護細胞膜生物學功能有密切聯(lián)系，是內因性細胞調節(jié)因子的前體，具有保護肝臟和降低血清膽固醇的功能。但一般大豆卵磷脂不含有20個碳以上的脂肪酸，所以降低血清膽固醇和保護肝臟等功能低于蛋黃卵磷脂。

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